Zéniers besteforeldre på farssiden var innvandrere fra Italia som kom til Lorraine for å jobbe i gruvedrift. Faren hans, Serge, var fotballspiller for Metz. Seksten år gammel gikk Bernard Zénier i sin fars fotspor da han tilsluttet seg Metz.[1] Noen få dager før syttenårsdagen debuterte han for Metz i fransk 1. divisjon mot Lyon, og kronet debuten med et mål.[2]
Allerede nitten år gammel fikk venstrebente Zénier sin debut for det franske herrelandslaget i en treningskamp mot Vest-Tyskland. Ett år senere forlot han Metz til fordel for lokalrivalen Nancy. I 1983 dro han videre til Bordeaux. Den enslige sesongen han spilte for Bordeaux ble han seriemester. Deretter gikk ferden videre til Marseille. Da Bernard Tapie ankom Marseille i 1984, ble Zénier satt på døren. Han dro så tilbake til moderklubben Metz. Med atten scorede mål for Metz var Zénier topp målscorer i fransk 1. divisjon i 1986/87-sesongen. I spann med Carmelo Micciche hadde Metz en effektiv angrepsduo, som hjalp laget vinne Coupe de France i 1987/88-sesongen. I 1991 avrundet Zénier spillerkarrieren. Da hadde han spilt 466 seriekamper i den fransk toppdivisjonen og laget 130 mål.