Redigerer Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification

'''RT-LAMP''' eller '''Reverse transcriptase loop-mediated isothermal amplification''' er en ettrinns polymerasekjedereaksjonsmetode for å multiplisere spesifikke [[RNA]]-sekvenser. Den benyttes for å diagnostisere smittsomme sykdommer som er forårsaket av RNA-[[virus]]er.<ref name="Mori_2009">{{cite journal|vauthors=Mori Y, Notomi T|year=2009|title=Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): a rapid, accurate, and cost-effective diagnostic method for infectious diseases|journal=J. Infect. Chemother.|volume=15|issue=2|pages=62–9|doi=10.1007/s10156-009-0669-9|pmc=7087713|pmid=19396514}}</ref> 

Den kombinerer [[loop-mediated isothermal amplification]] (LAMP)<ref>{{Cite journal|last1=Notomi|first1=Tsugunori|last2=Okayama|first2=Hiroto|last3=Masubuchi|first3=Harumi|last4=Yonekawa|first4=Toshihiro|last5=Watanabe|first5=Keiko|last6=Amino|first6=Nobuyuki|last7=Hase|first7=Tetsu|date=2000-06-15|title=Loop-mediated isothermal amplification of DNA|journal=Nucleic Acids Research|volume=28|issue=12|pages=e63|doi=10.1093/nar/28.12.e63|issn=0305-1048|pmid=10871386|pmc=102748}}</ref> DNA-deteksjon med [[revers transkriptase]], for å lage [[Komplementært DNA|cDNA]] fra RNA før reaksjonen blir foretatt.<ref name="Fu_2011">{{cite journal|vauthors=Fu S, Qu G, Guo S, Ma L, Zhang N, Zhang S, Gao S, Shen Z|year=2011|title=Applications of loop-mediated isothermal DNA amplification|journal=Appl. Biochem. Biotechnol.|volume=163|issue=7|pages=845–50|doi=10.1007/s12010-010-9088-8|pmid=20844984|s2cid=45682156}}</ref>  RT-LAMP krever (til forskjell fra [[PCR]]) ikke noen [[PCR-maskin]] ''(Thermal cycler)'' og gjennomføres til en konstant temperatur på mellom 60 og 65&nbsp;°C. 

RT-LAMP benyttes for deteksjon av [[RNA-virus]]er (GroupS II, IV, og V etter [[Baltimoreklassifikasjonen|Baltimore virusklassifisering]]ssystemet), som [[SARS-CoV-2]]-viruset<ref name=":0">{{Cite journal|last1=Kellner|first1=Max J.|last2=Ross|first2=James J.|last3=Schnabl|first3=Jakob|last4=Dekens|first4=Marcus P. S.|last5=Heinen|first5=Robert|last6=Grishkovskaya|first6=Irina|last7=Bauer|first7=Benedikt|last8=Stadlmann|first8=Johannes|last9=Menéndez-Arias|first9=Luis|last10=Fritsche-Polanz|first10=Robert|last11=Traugott|first11=Marianna|date=2020-07-23|title=A rapid, highly sensitive and open-access SARS-CoV-2 detection assay for laboratory and home testing|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.23.166397v2|journal=bioRxiv|language=en|pages=2020.06.23.166397|doi=10.1101/2020.06.23.166397|s2cid=220835822}}</ref><ref name=":1">{{Cite journal|title=Rapid and extraction-free detection of SARS-CoV-2 from saliva with colorimetric LAMP|year=2020|doi=10.1101/2020.05.07.20093542|last1=Lalli|first1=Matthew A.|last2=Langmade|first2=S Joshua|last3=Chen|first3=Xuhua|last4=Fronick|first4=Catrina C.|last5=Sawyer|first5=Christopher S.|last6=Burcea|first6=Lauren C.|last7=Wilkinson|first7=Michael N.|last8=Fulton|first8=Robert S.|last9=Heinz|first9=Michael|last10=Buchser|first10=William J.|last11=Head|first11=Richard D.|last12=Mitra|first12=Robi D.|last13=Milbrandt|first13=Jeffrey|journal=MedRxiv|pmid=32511508|pmc=7273276}}</ref> og [[Ebolavirus]]et <ref>{{Cite journal|last1=Kurosaki|first1=Yohei|last2=Magassouba|first2=N’Faly|last3=Oloniniyi|first3=Olamide K.|last4=Cherif|first4=Mahamoud S.|last5=Sakabe|first5=Saori|last6=Takada|first6=Ayato|last7=Hirayama|first7=Kenji|last8=Yasuda|first8=Jiro|date=2016-02-22|title=Development and Evaluation of Reverse Transcription-Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) Assay Coupled with a Portable Device for Rapid Diagnosis of Ebola Virus Disease in Guinea|journal=PLOS Neglected Tropical Diseases|language=en|volume=10|issue=2|pages=e0004472|doi=10.1371/journal.pntd.0004472|pmid=26900929|pmc=4764121|issn=1935-2735|doi-access=free}}</ref>

I arbeidet mot [[covid-19]] har japanske forskere ved sammenligning mellom [[RP-PCR]]-testing av asymptomatiske personer og den mindre alminnelig benyttede og mer RT-LAMP-testen i 2029 funnet at antallet positive og negative resultater var nokså like. De nasopharyngeale prøvene (RP-PCR) og spyttprøvene (RP-LAMP) klarte å detektere dem med infeksjonen i henholdsvis 77-93% og 83-97% av tilfellene. Begge testmetoder kunne også identifisere dem uten infeksjonen hos 99,9% av de smittede av de asumptotiske.<ref>[https://www.global.hokudai.ac.jp/blog/covid-19-saliva-tests-could-detect-the-silent-carriers/ Hokkaido University: COVID-19: Saliva tests could detect the silent carriers] 28. september 2020, lest 1. oktober 2020</ref> Dette er en høyere treffsikkerhet enn tiodligere antatt, og ettersom RT-LAMP er en reaskere gjennomførbart metode, og en metode der personen på egen hånd kan frembringe det som skal analyseres, mente forskere ved [[Hokkaido University]] at den kunne egne seg særlig godt i en rekke tilfeller, som ved massetesting, og også ved at den innebærer en minimal risiko for helsearbeiderne.

==Referanser==
<references/>

{{Autoritetsdata}}

[[Kategori:Molekylærbiologi]]
[[Kategori:Testing for covid-19]]