Redigerer Marinejegerkommandoen (avsnitt)

==== Balkan ====
NATO overtok ansvaret for det internasjonale militære engasjementet på Balkan etter FN i desember 1995, og utvalgt personell fra MJK og FSK løste oppdrag på Balkan i siste halvdel av 1990-årene.<ref name=":49">{{Kilde bok|url=https://www.worldcat.org/oclc/844029812|tittel=Våre hemmelige soldater : norske spesialstyrker 1940-2012|etternavn=Melien|fornavn=Tor Jørgen|dato=2012|utgiver=Spartacus|år=|isbn=9788243006805|utgivelsessted=Oslo|side=319|sider=|kapittel=|oclc=844029812|sitat=}}</ref> Nato organiserte spesialstyrkeoperatørene gjennom Combined Joint Special Operations Task Force (CJSOTF) hovedkvarteret, lokalisert i Sarajevo som del av [[SFOR|Stabilisation Force]] (SFOR) hovedkvarteret, og her tjenestegjorde stabsoffiserer fra begge de norske spesialstyrkene.<ref name=":49" />

Oppdragene inkluderte beskyttelse av viktig personell og infrastruktur, men også virke som [[liaison]]er og rådgivere som Joint Commision Observers (JCO).<ref name=":49" /> JCO-oppdraget var den første skarpe utenlandsoperasjonen Norge hadde i en ren spesialstyrkerolle etter 1945.<ref>{{Kilde bok|url=https://www.worldcat.org/oclc/844029812|tittel=Våre hemmelige soldater : norske spesialstyrker 1940-2012|etternavn=Melien|fornavn=Tor Jørgen|dato=2012|utgiver=Spartacus|år=|isbn=9788243006805|utgivelsessted=Oslo|side=|sider=319-320|kapittel=|oclc=844029812|sitat=}}</ref> JCO-oppdragene innebar å opprette og formidle kontakt mellom vanskelig tilgjengelige beslutningstakere hos de ulike partene, og i tillegg å videreformidle informasjon om disse til eget hovedkvarter.<ref name=":50">{{Kilde bok|url=https://www.worldcat.org/oclc/844029812|tittel=Våre hemmelige soldater : norske spesialstyrker 1940-2012|etternavn=Melien|fornavn=Tor Jørgen|dato=2012|utgiver=Spartacus|år=|isbn=9788243006805|utgivelsessted=Oslo|side=320|sider=|kapittel=|oclc=844029812|sitat=}}</ref> Marinejegerkommandoen ledet JCO-oppdraget i 18 måneder fra tidlig i 1999, og personellet inngikk i laget fra 3 til 12 måneder og besto hovedsakelig av marinejegere.<ref name=":50" /> Det norske JCO-lagets ansvarsområde var i den serbiske delen av Bosnia, og Bosnia-serberne ble naturligvis svært mistenksomme og fiendtlig innstilt mot de allierte spesialstyrkene.<ref name=":50" /> Nordmenne klarte å overkomme dette ved kløktig opptreden og god hjelp av serbernes takknemlighet for norsk støtte til serbiske krigsfanger i Norge under 2. verdenskrig.<ref name=":50" /> JCO-oppdragene viste seg gjentatte ganger avgjørende i å hindre episoder som kunne ført til åpen konflikt.<ref name=":49" /> Erfaringen fra JCO-oppdragene tilsa økt fokus på operatørutdanning som dekket mellommenneskelige forhold som kommunikasjon, konfliktløsning og gruppe-utvikling.<ref name=":50" /> I dette lå også et klart ønske om at spesialstyrkeoperatørene så eldre ut og selv hadde betydelig livserfaring.<ref name=":50" />