Redigerer Sør-Sudan (avsnitt)

=== 1800-tallet ===
[[Fil:Muhammad Ahmad al-Mahdi.jpg|mini|[[Muhammad Ahmad]]]]
I 1820-årene ble store deler av dagens Sudan invadert av [[Det osmanske rike]], mens senere på 1800-tallet påberopte [[Egypt]] seg å representere også Sudan. For å understreke dette kravet, også i sør, ble [[Ekvatorialprovinsen]] etablert i 1870. 
{{Utdypende|Mahdistopprøret}}
I 1881 erklærte [[Muhammad Ahmad]] at han var [[mahdi]], direkte etterkommer etter [[Muhammed]], og hans religiøse bevegelse var opphavet til [[Mahdistopprøret|en bred nasjonal oppstand]] i [[1883]]. Store deler av Sudan kom under opprørernes kontroll, og i [[1885]] ble hovedstaden [[Khartoum]] inntatt. Al-Mahdi døde samme år, og hans etterfølgere led nederlag for de felles [[Storbritannia|britiske]] og egyptiske styrkene under ledelse av [[Herbert Kitchener]] i [[1898]].

Sudan ble erklært et [[kondominium]] under felles britisk-egyptisk styre.

Kristendommen reintrodusert av britiske misjonærer i Sør-Sudan, som kom inn i området fra den britiske kolonien i [[Kenya]]. De første katolske misjonærene kom i 1842, mens anglikanske og amerikanske [[Presbyterianisme|presbyterianere]] kom rundt 1899.