Redigerer Red Hot Chili Peppers (avsnitt)

=== ''Californication'' (1998–2001) ===
[[Fil:John Frusciante 2.jpg|200px|right|thumb|John Frusciante på scenen på Reading Madejski Stadium]]
I årene etter at John Frusciante forlot bandet ble det kjent at han hadde utviklet en alvorlig heroinavhengighet, som førte til at han ble fattig og nesten døde.<ref>{{Kilde www
 |url = http://www.rollingstone.com/artists/redhotchilipeppers/articles/story/5923940/red_hot_redux
 |tittel = Red Hot Redux
 |besøksdato = 2007-03-31
 |forfatter = Skanse, Richard
 |utgivelsesdato = 1998-04-30
 |utgiver = RollingStone.com
 |arkiv_url = https://web.archive.org/web/20090228174015/http://www.rollingstone.com/artists/redhotchilipeppers/articles/story/5923940/red_hot_redux
 |arkivdato = 2009-02-28
 |url-status=død
 }}</ref> Han ble overtalt til å legge seg inn på rehabiliteringssentert Las Encinas Drug Rehabilitation Center i januar 1998.<ref>Kiedis, Sloman, 2004. p. 397</ref><ref>{{Kilde www
 |url = http://www.allmusic.com/artist/john-frusciante-p78092
 |tittel = John Frusciante Biography
 |besøksdato = 2007-08-08
 |forfatter = Prato, Greg
 |utgiver = [[Allmusic]]
}}</ref> Han kunne forlate senteret i februar samme år og leide seg en liten leilighet i Silver Lake.<ref>Kiedis, Sloman, 2004. p. 398</ref> Problemene og skadene stilte seg formelig i kø for Frusciante i løpet av årene med rusmiddelavhengighet, og for noen av dem var det nødvendig med kirurgi. Han fikk en rekonstruert nese og nye tenner for å hindre dødelige infeksjoner.<ref>{{Kilde www
 |url = http://www.guardian.co.uk/music/2003/feb/14/artsfeatures.popandrock
 |tittel = It's great to go straight
 |besøksdato = 2008-08-15
 |forfatter = Dave Simpson
 |utgivelsesdato = 2003-02-14
 |utgiver = ''[[The Guardian]]''
}}</ref>

I april 1998 bestemte Flea seg for å besøke sin gamle bandkamerat og invitere ham til å bli med i bandet igjen, noe Frusciante gjorde.<ref>«stpg398»</ref> I løpet av mindre enn ei uke, og for første gang på seks år, begynte den gjenforente kvartetten å spille sammen.<ref>Kiedis, Sloman, 2004. p. 389–400</ref> Anthony Kiedis beskrev situasjonen slik:<ref>Kiedis, Sloman, 2004. p. 399</ref>

{{Sitat|For me, that was the defining moment of what would become the next six years of our lives together. That was when I knew that this was the real deal, that the magic was about to happen again. Suddenly we could all hear, we could all listen, and instead of being caught up in our finite little balls of bullshit, we could all become players in that great universal orchestra again.}}

Til tross for bandmedlemmenes glede over å ha Frusciante tilbake i bandet, var han nedslitt både fysisk og mentalt. Frusciante hadde ikke spilt gitar på flere år og det var vanskelig for ham å prioritere livet fremfor rusmidlene. Trass i dette begynte Frusciante etterhvert å spille som det talentet han hadde vært, og nye sanger tok form. 8. juni 1999, etter et år med produksjon og nitid øving, ble ''[[Californication (album)|Californication]]'' gitt ut som bandets syvende studioalbum. Albumet ble solgt i over 15 millioner eksemplarer over hele verden og er til dags dato bandets mest suksessfulle utgivelse.<ref>{{Kilde www
 |url = http://news.bbc.co.uk/1/hi/entertainment/3864401.stm
 |tittel = Chili Peppers' album tops survey
 |besøksdato = 2007-04-20
 |utgivelsesdato = 2004-07-04
 |utgiver = BBC
}}</ref> Californication inneholdt færre rapdrevne sanger enn sine forgjengere. I stedet satset bandet mer på stukturerte og melodiøse gitarriff, vokal- og basslinjer.<ref>{{Kilde www
 |url = http://www.allmusic.com/album/r417478
 |tittel = Californication > Overview
 |besøksdato = 2008-01-28
 |forfatter = Prato, Greg
 |utgiver = [[Allmusic]]
}}</ref>

Californication nådde tredjeplass på den amerikanske albumlista<ref>Billboard.com</ref> og bandet ytterligere tre nummer én moderne rock-hits: «[[Scar Tissue]]», «[[Otherside]]» og «[[Californication (sang)|Californication]]». «Scar Tissue» vant Grammyprisen 2000 for Beste rocksang. Red Hot Chili Peppers spilte også denne sangen sammen med [[Snoop Dog]] under seremonien. Blant andre singler fantes «[[Around the World]]», «[[Road Trippin]]» og «[[Parallel Universe]]», som gikk inn på Moderne rock topp 40-lista til tross for ikke å ha blitt kommersielt utgitt som single.

I juli 1999, som en del av bandets to år lange verdensturné i tilnytning til utgivelsen av det nye albumet, spilte Red Hot Chili Peppers på Woodstock-festivalen. Omtrent 10 minutter før konserten startet ble bandet spurt av [[Jimi Hendrix]]' søster om å spille en av sin brors sanger. Etter noe nøling gikk bandet med på å spille klassikeren «[[«Fire» (Jimi Hendrix)|Fire]]». Tilfeldigvis brøt det ut en liten brann i løpet av konserten. Denne utviklet seg raskt til en større brann og førte til at brannvesenet måtte rykke ut.<ref>{{Kilde www
 |url = http://www.rollingstone.com/artists/redhotchilipeppers/articles/story/5921381/woodstock_99_burns_its_own_mythology
 |tittel = Woodstock '99 Burns Its Own Mythology
 |besøksdato = 2007-03-31
 |forfatter = Eliscu, Jenny
 |utgivelsesdato = 1999-07-26
 |utgiver = RollingStone.com
 |arkiv_url = https://web.archive.org/web/20090224220920/http://www.rollingstone.com/artists/redhotchilipeppers/articles/story/5921381/woodstock_99_burns_its_own_mythology
 |arkivdato = 2009-02-24
 |url-status=død
 }}</ref>

I 2001 ga Red Hot Chili Peppers ut sin første konsert-DVD, ''[[Off the Map]]''. DVD-en ble produsert av [[Dick Rude]], en trofast venn av bandet som også hadde produsert videoene for «[[Catholic School Girls Rule]]» og «[[Universally Speaking]]». Videomaterialet besto stort sett i utdrag fra en rekke forskjellige Red Hot Chili Peppers-konserter.