Redigerer Dodekanesene (avsnitt)

=== Senantikken og middelalderen ===
[[Fil:Vue du Monastère Saint-Jean-le-Théologien de Patmos.JPG|thumb|upright|left|Sankt Johannes' klosterfestning på Patmos.]]
[[Fil:RhodesIntérieurDuPalais.JPG|thumb|Den indre del av middelalderpalasset i byen Rhodos]]
Da Romerriket delte seg i to i 395 e.Kr. i en vestlig og en østlig del, havnet øyene inn under [[Østromerriket]] som senere utviklet seg til Det bysantinske rike. Øyene forble bysantinske i de neste tusen år, men utsatt for angrep og invasjoner tallrike ganger. I denne perioden fikk øynene likevel en stadig mer uavhengig status og framsto som en enhet. Det var i denne perioden at begrepet «Dodekanesene» oppsto en gang på 700-tallet, ''Dhodekanisos/Dhodeka'' = 12 og ''nisos'' = øy, blant annet av den bysantinske historikeren [[Georgios Kedrenos]], men han som andre skribenter spesifiserte ikke hvilke øyer som var inkludert.<ref>[http://www.heavenly-greek-islands.com/dodecanese-greece.html «Dodecanese Greece»] {{Wayback|url=http://www.heavenly-greek-islands.com/dodecanese-greece.html |date=20130524032213 }}</ref> Tallrike levninger fra den bysantinske perioden eksisterer den dag i dag, særlig i de hundrevis av kirker som finnes i ulik grad av bevarelse.

På [[1200-tallet]] med [[det fjerde korstog]] begynte [[Italia|italienere]] å invadere deler av Dodekanesene som hadde vært under herredømmet til [[keiserriket Nikea]]. Herskerfamilier fra republikkene [[Republikken Venezia|Venezia]] (Querini, Cornaro) og [[Republikken Genova|Genova]] (Vignoli) behersket en del av øyene for en tid mens [[Basilios den store|basilioske]] munker hersket på [[Patmos]] og [[Leros]]. På [[1300-tallet]] ebbet den bysantinske epoken ut da øyene ble tatt med makt av [[Malteserordenen|hospitallerordenen]] (den senere [[malteserordenen]]): Rhodos ble erobret i [[1309]] og de øvrige øynene falt gradvis i løpet av de neste tiårene.<ref>{{Kilde www |url=http://www.orderstjohn.org/osj/history.htm |tittel=The Order of Saint John of Jerusalem, Knights Hospitaller |besøksdato=2013-05-01 |arkiv-dato=2011-07-18 |arkiv-url=https://web.archive.org/web/20110718035130/http://www.orderstjohn.org/osj/history.htm |url-status=død }}</ref> Ridderorden gjorde Rhodos til sin hovedbase, omformet hovedstaden til en storslått middelalderby, dominert av en mektig festning, og spredte festninger og forsvarsanlegg over resten av øya.<ref>[http://www.middle-ages.org.uk/knights-hospitaller.htm Knights Hospitaller]</ref>

Disse massive festningsverkene viste seg å være utilstrekkelige i å slå tilbake angrep fra [[muslim]]ene i [[Egypt]] i [[1444]] og av [[Muhammad II]] (eller Mehmed II) i [[1480]].<ref>[http://romeartlover.tripod.com/Rodi.html Rhodes - Introduction]</ref><ref>[http://whc.unesco.org/en/list/493 «Medieval City of Rhodes»], ''UNESCO World Heritage Centre''</ref> I [[1522]] falt festningen i Rhodos for den store hæren til sultan [[Suleiman I den store|Suleiman]] og de andre øyene ble tatt i løpet av et år. De gjenværende ridderne flyktet videre til [[Malta]].