Redigerer Kleopatra (avsnitt)

==== Drapet på Pompeius ====
[[Fil:Mommsen p733.jpg|thumb|150px|left|Pompeius' profil.]]
Mens Kleopatra var i landflyktighet, ble Ptolemaios innviklet i [[Cæsars borgerkrig|den romerske borgerkrigen]]. Etter [[slaget ved Farsalos]] i nordlige Hellas i begynnelsen av august [[48 f.Kr.]] hvor [[Julius Cæsar]] beseiret sin motstander [[Pompeius]]' hær og således fikk kontroll over den [[romerske republikk]], flyktet Pompeius fra Cæsars hær og kom seg til Alexandria hvor han ville søke tilflukt. Ptolemaios var en guttunge, kun 13 år gammel, og han fikk satt opp en trone for seg selv i Alexandrias havn, og derfra kunne han se den 29. september 48 f.Kr. at den flyktende romerske hærføreren bli myrdet av en av sine tidligere offiserer, nå i ptolemeisk tjeneste. Han ble stukket ned og halshogd foran sin hustru og sin barn som var om bord i skipet som han nettopp hadde forlatt.<ref>Plutark: ''Pompeius'', 79–80</ref>

Det er antatt at Ptolemaios hadde beordret mordet for å innynde seg overfor Cæsar i håp om å bli hans allierte, men det var en feilslutning. Da Cæsar ankom Egypt to dager senere presenterte Ptolemaios ham hodet til Pompeius. Julius Cæsar ble rasende. Selv om Pompeius var Cæsars fiende, var han også en [[romersk konsul]] og enkemann for Cæsars eneste legitime datter [[Julia (datter av Julius Cæsar)|Julia]] (som døde i barsel med Pompeius' sønn). Cæsar tok den egyptiske hovedstaden og framstilte seg selv som en megler mellom de rivaliserende kravene til Ptolemaios og Kleopatra.