Redigerer Tsjagataikhanatet (avsnitt)

===Khaner av [[Mughalistan]]===
[[FIL:Chagatai Khanate (1490).png|thumb|left|Det østlige Tsjagatai-khanatet i 1490.]]

*[[Tughlugh Temür]] (i Vest-Tsjagatai-khanatet [[1358]]&ndash;[[1363]]) [[1348]]-1363
*[[Ilyas Khoja]] (i Vest-Tsjagatai-khanatet 1363) 1363-[[1368]]
*[[Qamar ad-Din (Moghulistan)|Qamar ad-Din]] (i [[Kashgar]]; tronraner) 1368-[[1392]]
*[[Khidr Khoja]] [[1389]]&ndash;[[1399]]
*[[Shams-I-Jahan]] 1399-[[1408]]
*[[Muhammad Khan]] 1408-[[1415]]
*[[Naqsh-I-Jahan]] 1415-[[1418]]
*[[Awais Khan]], [[Uwais Khan]] ibn Sher 'Ali  (også kalt Vais Khan) 1418-[[1421]] d. [[1429]]
*[[Shir Muhammad]] ibn Shah Jahan 1421-[[1425]]
*Awais Khan, [[Uwais Khan]] ibn Sher 'Ali (gjeninnsatt) 1425-[[1429]]
*[[Satuq Khan]] 1429-[[1434]] sammen med
*[[Esen Buqa II]] ibn Uwais Khan 1429-[[1462]]
*[[Yunus Khan]] (in [[Uyghurstan]] [[1472]]&ndash;[[1487]]) 1462-1487

''Moghulistan deles i to, det vestlige og østlige (Uyghurstan). For khanene av [[Turfan]], se Uyghurstan-khanene nedenfor.''

*[[Mahmud Khan (Moghul Khan)|Mahmud Khan]] ibn Yunus Khan 1487-[[1508]]
I 1508 erobret Uzbek Khan Seybani Tashkent. Mahmud Khan og hans sønner ble henrettet.
*[[Mansur Khan (Moghul Khan)|Mansur Khan ibn Ahmad]] (Ahmad Khans sønn) (i Turfan [[1503]]&ndash;[[1543]]) 1508-[[1514]] d. 1543
*[[Sultan Said Khan]] (Mansur Khans bror) 1514-[[1533]]

I 1514 erobret han [[Kashgar]] og [[Tarimbekkenet]] fra [[dughlatene]] og gjenopprettet [[Yarkand-khanatet]].

Said Khans etterfølgere:
*[[Abdurashid Khan]] (in [[Aqsu]] [[1521]]-1533) 1533-[[1560]]
*[[Kuraysh]] ([[Khotan]] 1533-[[1588]]; Turfan [[1570]]-1588) [[1571]]-1588
*[[Abdul Karim]] 1560-[[1591]]
*[[Muhammed II (Moghulkhan)|Muhammed II]] (i Turfan 1588-1591) 1591-[[1610]]
*[[Abd al-Latif Anak Khan]] 1610-[[1627]]
*[[Shodja ad-Din Ahmad Khan]] (Pulad Khan) 1627-[[1632]]
*[[Mahmud Sultan]] (Qilich Khan) 1632-[[1634]]
*Shudja ad-Din Ahmad Khan (Pulad Khan)(gjeninnsatt) 1634-[[1638]]
*[[Abdallah (Moghulkhan)|Abdallah]] (i Turfan 1634/[[1635|5]]-1638/[[1639|9]]) 1638-[[1669]] d. [[1675]]
*[[Nur ad-Din (Moghulkhan)|Nur ad-Din]] 1669
*[[Ismail (Moghulkhan)|Ismail]] (in Aqsu [[1666]]&ndash;[[1670]]) 1669
*[[Ilbars]] 1669-1670
*Ismail Khan(gjeninnsatt) 1670-[[1678]]
*[[Abd ar-Rashid Khan II]] (i Turfan [[1680]]-1682) 1678-[[1681]]
*[[Abakh Khoja]] 1681-[[1694]]
*[[Yahya Khoja ibn Appaq Khoja]] 1694-[[1695]]

''Restene av staten ble erobret av [[Aqtaghlyq]], en føderasjon under dzjungarenes innflytelse.''

====Khaner av Uyghurstan====

*[[Dost Muhammad (Moghulkhan)|Dost Muhammad]] [[1462]]&ndash;[[1468]]
*[[Kebek Sultan]] 1468-[[1472]]
*[[Yunus Khan]] (i Mogulistan [[1462]]&ndash;[[1487]]) 1472-1487
*[[Ahmad Alaq]] (i Kashgar 1499-1501) 1487-[[1503]]
*[[Mansur Khan (Moghulkhan)]] (i Mogulistan [[1508]]&ndash;[[1514]]) 1503-[[1543]]

Mansur Khans etterfølgere:
*[[Shah Khan]] 1543-[[1570]]
*[[Kuraysh]] (Khotan [[1533]]&ndash;[[1588]]; Mogulistan 1570-88) 1570-1588
*[[Muhammad (Moghul Khan)]] (i Kashgaria [[1591]]&ndash;[[1610]]) 1588-1591
*[[Abd ar-Rahim]] 1591-[[1634]]/[[1635|5]] with
*[[Muhammad Khashim]] (i [[Chalish]]) [[1608]]&ndash;[[1610]]
*[[Abdallah (Moghulkhan)|Abdallah]] (i Chalish, i Kashgaria [[1638]]&ndash;[[1669]]) 1634/5-[[1639]] with
*[[Abu'l Muhammad]] 1635-[[1653]]
*[[Sultan Sa'id Baba Khan]] 1653 d. [[1680]]
*[[Ibrahim of Turfan|Ibrahim]] 1653-[[1655]]
*[[Sultan Sa'id Baba Khan]] (gjeninnsatt) [[1655]]-1680
*[[Abd ar-Rashid Khan]] (i Mogulistan [[1678]]&ndash;[[1681]]) 1680-[[1682]] d. [[1694]]

''Annektert av [[Dzjungar-khanatet]].''