Redigerer Krigsskip i hellenistisk tid (avsnitt)

===Borgerkrigene===
De romerske borgerkrigene som hadde deres sprede begynnelse i [[forbundsfellekrigen]] (91-88 f.Kr) og maktkampen mellom [[Sulla]] og [[Gaius Marius]], rystet det store romerske imperiet. De indre stridighetene likevel forstyrret ikke den romerske ekspansjonen mot til dels alvorlige ytre trusler. Den romerske marinen på nytt skulle utspille en viktig rolle under de indre stridigheter, spesielt etter Cæsars kryssing av [[Rubicon]] den 10. januar 49 f.Kr. Under den romerske borgerkrigen i hans navn gjenopprettet Cæsar Romas herredømme i det østlige Middelhavet etter å ha underlagt seg [[Levanten]] og elimintert den siste gjenværende militære trusselen i Lilleasia, Pontos. Etter mordet på Cæsar brøt borgerkrigene ut på nytt i 44 f.Kr.

I øst hadde den republikanske fraksjonen etablert sin kontroll over Egeerhavet med sine sjøstyrker som overfalte og plyndret [[Det andre triumvirat|triumviratet]]s allierte [[Rhodos]]. Den siste uavhengige marinen i Egeerhavet ble oppløst med makt av [[Gaius Cassius Longinus]] i 43 f.Kr. I vest hadde [[Sextus Pompeius]] som var utnevnt som admiral av senatet for den italienske flåten, sluttet seg til den republikanske fraksjonen og gjorde Sicilia til sin base.

[[Octavian]] fikk til oppgave om å sikre triumvirenes herredømme i det vestlige Middelhavet mens Marcus Antonius dro østover for å gjøre likedan. Etter å ha lidd et nederlag i 42 f.Kr mot Sextus, startet Octavian en massive utrustning for å bygge seg en flåte under kommando av sin nære medarbeider [[Marcus Vipsanius Agrippa]]. Til slutt beseiret Agrippa Sextus i slaget ved Naulochus i 36 f.Kr, med dette var borgerkrigen mellom triumvirene og den republikanske fraksjonen avsluttet.

Octavians makt ble ytterligere forsterket etter sin seier mot de kombinerte flåtene av [[Marcus Antonius]] og den egyptiske dronningen [[Kleopatra]] i [[slaget ved Actium]] i 31 f.Kr. Dette siste sjøslaget i den romerske republikkens ære hadde ikke bare etablerte Octavian som enehersker over Roma og middelhavsområdet, men også rensket Middelhavet for potensielle maritime utfordrere mot romerne. Den romerske marinen etter borgerkrigene var nå den eneste marineorganisasjon i det romerske ''Mare Nostrum''.