Redigerer Nagorno-Karabakh (avsnitt)

=== Krigen etter Sovjetunionens oppløsning ===
Ved [[Sovjetunionen]]s oppløsning i 1991, var området en [[Selvstyrt område|autonom]] del av Aserbajdsjan. Imidlertid ble området dominert av en armensk befolkning (76&nbsp;%). Med moralsk og materiell støtte fra Armenia startet en bevegelse for å få området overført til Armenia. Dette resulterte i en folkeavstemning [[10. desember]] 1991. Et overveldende flertall stemte for uavhengighet fra Aserbajdsjan, men avstemningen ble boikottet av det aseriske mindretallet (23&nbsp;%) av befolkningen. Den økende spenningen i området førte til voldsaksjoner mot armenere i Aserbajdsjan og aserier i Armenia, noe som resulterte i forflytning av store mengder aserier i armenske områder og armenere i aserbajdsjanske områder (bortsett fra Nagorno-Karabakh). Det beregnes at rundt 800&nbsp;000 mennesker har vært på flukt i eller fra området.

En av de mest blodige hendelsene i denne konflikten skjedde februar 1992, da armenske soldater massakrerte 613 sivile aserier, hvorav 108 var kvinner og 63 var barn, i byen [[Khojali]]. Hendelsen er kjent som [[Khojalymassakren]].<ref>{{Kilde www |url=http://www.hrw.org/reports/1993/WR93/Hsw-07.htm |tittel= The former Soviet Union|besøksdato=25. oktober 2007 |format= |verk= }}</ref>

Med angivelig russisk militær støtte på begge sider, gikk Armenia og Aserbajdsjan til krig [[12. mai]] [[1994]]. Etter russisk-initierte forhandlinger inngikk partene en uoffisiell våpenhvile. På slutten av 1990-årene ble situasjonen roligere. Situasjonen mellom de to landene har vært svært spent og det har vært flere militære trefninger mellom de to gruppene.<ref name=":0" />