Redigerer Fotosyntese (avsnitt)

==Fotodelen (den lysavhengige delen)==
[[Fil:Calvin-cycle3.png|thumb|400px|[[Syntesedelen|Calvinsyklus]] (mørkereaksjonene)]]
Fotodelen foregår i [[kloroplast]]ene i tylakoidmembranen som skiller [[stroma]] fra innsiden av tylakoiden ([lumen]). Prosessen starter når [[foton]]er absorberes av [[fotosystem]] II som er et [[protein]]kompleks forankret i thylakoidmembranen. Et fotosystem består av [[pigment]]er, som [[klorofyll]] og [[betakaroten]], organisert i en antennestruktur for bedre å kunne absorbere det innkommende lyset. Når fotoner treffer pigmentmolekylene slår de elektroner ut i et høyere energinivå, elektronene blir [[eksitasjon|eksitert]]. Når elektronene vender tilbake til [[Kvantetilstand|grunntilstanden]] avgis det energi som fanges opp av et annet pigment i nærheten. Denne energien går fra pigmenter som absorberer lys med korte [[bølgelengde]]r til pigmenter som absorberer lys med lengre bølgelengder, inntil fotosystemets reaksjonssenter nås. Fotosystemets reaksjonssenter er en samling av klorofyll a. Det sentrale klorofyll a-molekylet absorberer lys med bølgelengde opptil 680&nbsp;nm (i fotosystem II), og reaksjonssenteret kalles derfor [[P680]].  Klorofyll a-molekylet blir oksidert og ett elektron blir sendt gjennom en elektrontransportkjede. Fotosystem II, som nå mangler ett elektron, får tilført elektroner kontinuerlig fra vann (så lenge det er sollys til stedet), som oksideres av et vannsplittingskompleks:
 
<chem>H2O -> 2e- + 2H+ + \ce{\frac{1}{2}} O2</chem>

Elektronet i det sentrale klorofyllmolekylet i P680 blir eksitert, og før det rekker å falle tilbake i sitt opprinnelige skall, blir elektronet overført til en elektronmottager (A)

<chem>klorofyll-a + A -> klorofyll-a+ + A-</chem>

Elektrontransporten skyldes en rekke redoksreaksjoner. Når elektronene fraktes til et protein i tylakoidmembranen, kalt Plastokinon (PQ), blir H<sup>+</sup> bundet til PQ, og mens elektronene fraktes til Cytokromkomplekset blir H<sup>+</sup> fraktet inn i lumen. Dette bidrar til en protongradient som forårsaker produksjon av ATP (se nedenfor). Elektrontransporten fortsetter til PC (Plastocyanin) og videre til Fotosystem I. Nå fungerer disse elektronene som en etterfyller av elektroner som blir eksitert av det sentrale klorofyll-a-molekylet i fotosystem I (FS I). Fotosystem I sitt reaksjonssenter eksiterer elektroner ved en bølgelengde opptil 700&nbsp;nm, og blir derfor kalt P700.

Nå blir elektroner sendt til Fd (ferredoksin) og deretter til et enzym som katalyserer dannelsen av NADPH (NADH+-reduktase)

<chem>NADP+ + 2H+ -> NADPH + H+</chem>

Ved en overbelastning av elektrontransportkjeden i kloroplasten kan man få skader i proteinene i membranen, dette kalles [[fotoinhibering]].

Energien fra elektronene som beveger seg mellom fotosystem II og I blir brukt til å pumpe H<sup>+</sup> inn i thylakoiden. Dette, sammen med spaltingen av vann, skaper en [[kjemiosmotisk]] gradient over membranen. Det vil derfor være et overskudd av H<sup>+</sup> i Lumen i forhold til Stroma. 
Denne protongradienten gjør at H<sup>+</sup> kan [[diffusjon|diffundere]] ut av thylakoiden gjennom et proteinkompleks, kalt [[ATP syntase]]. ATP syntase utnytter strømmen av H<sup>+</sup> til å omdanne [[ADP + Pi]] til [[Adenosintrifosfat|ATP]] og vil fortsette så lenge det er en protongradient over thylakoidmembranen.

ATP syntase er et stort proteinkompleks som ligger i membranen. På den delen som stikker ut mot stroma er det en topp bestående av 3 α-proteiner og 3 β-proteiner (enzymer). Det er på β-enzymene selve syntesen av ATP skjer.
For hver H<sup>+</sup> som diffunderer ut av thylakoiden vil β-enzymene alternere mellom 3 former:
L-form(Loose): Her binder ADP + Pi seg løst til enzymet
T-form(Tight): Her skjer sammenkoblingen. ADP + Pi → ATP
O-form(Open): ATP slippes ut
(For hvert ATP molekyl som dannes, kreves det minst 3 H<sup>+</sup>)