Redigerer
Elektronfangst dissosiasjon
(avsnitt)
Hopp til navigering
Hopp til søk
Advarsel:
Du er ikke innlogget. IP-adressen din vil bli vist offentlig om du redigerer. Hvis du
logger inn
eller
oppretter en konto
vil redigeringene dine tilskrives brukernavnet ditt, og du vil få flere andre fordeler.
Antispamsjekk.
Ikke
fyll inn dette feltet!
== Prinsipp == Elektronfangst dissosiasjon involverer vanligvis et multprotonert molekyl M som samhandler med et fritt elektron for å danne et enslig elektron-ion. Frigjøring av elektrisk potensiell energi resulterer i fragmentering av produktionet. <chem>[M {+} nH]^{n+} {+} e- -> [[M {+} nH]^{(n-1)+}]^' -> fragmenter</chem> Frekvensen av elektronfangst dissosiasjon avhenger ikke bare av frekvensen av ion-elektron fragmenteringsreaksjoner, men også av antall ioner i et ion-elektron-interaksjonsvolum. Elektronstrømtetthet og tverrsnitt av ECD er direkte proporsjonal med fragmenteringsfrekvensen.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Peptide and protein characterization by high-rate electron capture dissociation Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry|publikasjon=Journal of Mass Spectrometry|doi=10.1002/jms.658|url=http://doi.wiley.com/10.1002/jms.658|dato=Juli 2004|fornavn=Youri O.|etternavn=Tsybin|etternavn2=Ramström|fornavn2=Margareta|etternavn3=Witt|fornavn3=Matthias|etternavn4=Baykut|fornavn4=Gökhan|etternavn5=Håkansson|fornavn5=Per|serie=7|språk=en|bind=39|sider=719–729|issn=1076-5174|besøksdato=2021-04-17}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron Capture Dissociation for Structural Characterization of Multiply Charged Protein Cations|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac990811p|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac990811p|dato=Februar 2000|fornavn=Roman A.|etternavn=Zubarev|etternavn2=Horn|fornavn2=David M.|etternavn3=Fridriksson|fornavn3=Einar K.|etternavn4=Kelleher|fornavn4=Neil L.|etternavn5=Kruger|fornavn5=Nathan A.|etternavn6=Lewis|fornavn6=Mark A.|etternavn7=Carpenter|fornavn7=Barry K.|etternavn8=McLafferty|fornavn8=Fred W.|serie=3|språk=en|bind=72|sider=563–573|issn=0003-2700|besøksdato=2021-04-17}}</ref> En indirekte oppvarmet dispenserkatode brukt som elektronkilde resulterer i større elektronstrøm og større emitterende overflateareal.<ref name=":0">{{Kilde artikkel|tittel=Advantages of External Accumulation for Electron Capture Dissociation in Fourier Transform Mass Spectrometry|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac0015523|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac0015523|dato=Juli 2001|fornavn=Kim F.|etternavn=Haselmann|etternavn2=Budnik|fornavn2=Bogdan A.|etternavn3=Olsen|fornavn3=Jesper V.|etternavn4=Nielsen|fornavn4=Michael L.|etternavn5=Reis|fornavn5=Celso A.|etternavn6=Clausen|fornavn6=Henrik|etternavn7=Johnsen|fornavn7=Anders H.|etternavn8=Zubarev|fornavn8=Roman A.|serie=13|språk=en|bind=73|sider=2998–3005|issn=0003-2700|besøksdato=2021-04-17}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Improved low-energy electron injection systems for high rate electron capture dissociation in Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry: High rate ECD in FTICRMS|publikasjon=Rapid Communications in Mass Spectrometry|doi=10.1002/rcm.448|url=http://doi.wiley.com/10.1002/rcm.448|dato=2001-10-15|fornavn=Youri O.|etternavn=Tsybin|etternavn2=Håkansson|fornavn2=Per|etternavn3=Budnik|fornavn3=Bogdan A.|etternavn4=Haselmann|fornavn4=Kim F.|etternavn5=Kjeldsen|fornavn5=Frank|etternavn6=Gorshkov|fornavn6=Michael|etternavn7=Zubarev|fornavn7=Roman A.|redaktør-fornavn=David C.|redaktør-etternavn=Muddiman|serie=19|språk=en|bind=15|sider=1849–1854|besøksdato=2021-04-17}}</ref> <math>\text{Effektiviteten til ECD MS/MS} = \frac{\text{Totalt antall av fragmenterte ioner}}{\text{Totalt antall av forløper ioner}}</math> ECD-enheter kan ha to former. Det kan fange analytioner i løpet av ECD-stadiet eller kan gjennomgå strømningsmodus der dissosiasjon finner sted når analytioner strømmer kontinuerlig gjennom ECD-regionen. Gjennomstrømningsmodus har fordel i forhold til den andre modusen fordi nesten all analytionstrålen brukes. Dette reduserer imidlertid effektiviteten til ECD for gjennomstrømningsmodus.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron Capture Dissociation in a Branched Radio-Frequency Ion Trap|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac503773y|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac503773y|dato=2015-01-06|fornavn=Takashi|etternavn=Baba|etternavn2=Campbell|fornavn2=J. Larry|etternavn3=Le Blanc|fornavn3=J. C. Yves|etternavn4=Hager|fornavn4=James W.|etternavn5=Thomson|fornavn5=Bruce A.|serie=1|språk=en|bind=87|sider=785–792|issn=0003-2700|besøksdato=2021-04-17}}</ref> ECD produserer signifikant forskjellige typer fragmentioner (selv om primært c- og z-type, er b-ioner blitt identifisert i ECD<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Abundant b-type ions produced in electron capture dissociation of peptides without basic amino acid residues|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2007.08.015|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b02818|dato=November 2007|fornavn=Haichuan|etternavn=Liu|etternavn2=Håkansson|fornavn2=Kristina|serie=11|språk=en|bind=18|sider=2007–2013|issn=1044-0305|besøksdato=2021-04-17}}</ref>) enn andre MS/MS-fragmenteringsmetoder som [[elektron-løsrivelse dissosiasjon]] (EDD) (primært a og x-typer),<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Evaluation of the experimental parameters which control electron detachment dissociation, and their effect on the fragmentation efficiency of glycosaminoglycan carbohydrates|publikasjon=International Journal of Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.ijms.2008.05.017|url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1387380608001954|dato=Oktober 2008|fornavn=Franklin E.|etternavn=Leach|etternavn2=Wolff|fornavn2=Jeremy J.|etternavn3=Laremore|fornavn3=Tatiana N.|etternavn4=Linhardt|fornavn4=Robert J.|etternavn5=Amster|fornavn5=I. Jonathan|serie=2-3|språk=en|bind=276|sider=110–115|pmc=PMC2633944|pmid=19802340|besøksdato=2021-04-17}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Structural characterization of the GM1 ganglioside by infrared multiphoton dissociation, electron capture dissociation, and electron detachment dissociation electrospray ionization FT-ICR MS/MS|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2005.02.001|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b02412|dato=Mai 2005|fornavn=Melinda A.|etternavn=McFarland|etternavn2=Marshall|fornavn2=Alan G.|etternavn3=Hendrickson|fornavn3=Christopher L.|etternavn4=Nilsson|fornavn4=Carol L.|etternavn5=Fredman|fornavn5=Pam|etternavn6=Månsson|fornavn6=Jan-Eric|serie=5|språk=en|bind=16|sider=752–762|issn=1044-0305|besøksdato=2021-04-17}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Influence of Charge State and Sodium Cationization on the Electron Detachment Dissociation and Infrared Multiphoton Dissociation of Glycosaminoglycan Oligosaccharides|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2008.03.010|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b03195|dato=Juni 2008|fornavn=Jeremy J.|etternavn=Wolff|etternavn2=Laremore|fornavn2=Tatiana N.|etternavn3=Busch|fornavn3=Alexander M.|etternavn4=Linhardt|fornavn4=Robert J.|etternavn5=Amster|fornavn5=I. Jonathan|serie=6|språk=en|bind=19|sider=790–798|pmc=PMC2467392|pmid=18499037|besøksdato=2021-04-17}}</ref> [[kollisjonsindusert dissosiasjon]] (CID) (primært b<ref>{{Kilde artikkel|tittel=To b or not to b: The ongoing saga of peptide b ions|publikasjon=Mass Spectrometry Reviews|doi=10.1002/mas.20228|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/mas.20228|dato=Juli 2009|fornavn=Alex G.|etternavn=Harrison|serie=4|språk=en|bind=28|sider=640–654|issn=0277-7037|besøksdato=2021-04-17}}</ref> og y-type) og [[infrarød multifoton dissosiasjon]]. CID og IRMPD introduserer intern vibrasjonsenergi på en eller annen måte, forårsaker tap av endringer etter translasjon under fragmentering. I ECD observeres unike fragmenter (og komplementære til CID),<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Liquid chromatography electron capture dissociation tandem mass spectrometry (LC-ECD-MS/MS) versus liquid chromatography collision-induced dissociation tandem mass spectrometry (LC-CID-MS/MS) for the identification of proteins|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2007.01.008|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b02926|dato=Mai 2007|fornavn=Andrew J.|etternavn=Creese|etternavn2=Cooper|fornavn2=Helen J.|serie=5|språk=en|bind=18|sider=891–897|issn=1044-0305|pmc=PMC2572008|pmid=17350280|besøksdato=2021-04-17}}</ref> og evnen til å fragmentere hele makromolekyler effektivt har vært lovende. Selv om ECD primært brukes i [[Fourier-transform ion syklotron resonans]] massespektrometri, har<ref>{{Kilde artikkel|tittel=The role of electron capture dissociation in biomolecular analysis: ELECTRON CAPTURE DISSOCIATION|publikasjon=Mass Spectrometry Reviews|doi=10.1002/mas.20014|url=http://doi.wiley.com/10.1002/mas.20014|dato=Mars 2005|fornavn=Helen J.|etternavn=Cooper|etternavn2=Håkansson|fornavn2=Kristina|etternavn3=Marshall|fornavn3=Alan G.|serie=2|språk=en|bind=24|sider=201–222|besøksdato=2021-04-17}}</ref> etterforskere antydet at den har blitt brukt med hell i et [[ionefelle]] massespektrometer.<ref>Baba et al., Anal. Chem., 76:4263–4266, 2004.</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron Capture Dissociation in a Digital Ion Trap Mass Spectrometer|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac0519007|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac0519007|dato=Mars 2006|fornavn=Li|etternavn=Ding|etternavn2=Brancia|fornavn2=Francesco L.|serie=6|språk=en|bind=78|sider=1995–2000|issn=0003-2700|besøksdato=2021-04-17}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Structural analysis of O-glycopeptides employing negative- and positive-ion multi-stage mass spectra obtained by collision-induced and electron-capture dissociations in linear ion trap time-of-flight mass spectrometry|publikasjon=Rapid Communications in Mass Spectrometry|doi=10.1002/rcm.2885|url=http://doi.wiley.com/10.1002/rcm.2885|dato=2007-03-15|fornavn=Kisaburo|etternavn=Deguchi|etternavn2=Ito|fornavn2=Hiroki|etternavn3=Baba|fornavn3=Takashi|etternavn4=Hirabayashi|fornavn4=Atsumu|etternavn5=Nakagawa|fornavn5=Hiroaki|etternavn6=Fumoto|fornavn6=Masataka|etternavn7=Hinou|fornavn7=Hiroshi|etternavn8=Nishimura|fornavn8=Shin-Ichiro|serie=5|språk=en|bind=21|sider=691–698|besøksdato=2021-04-17}}</ref> ECD kan også gjøre rask integrering av flere skanninger i FTICR-MS hvis det settes i kombinasjon med ekstern akkumulering.<ref name=":0" /> ECD er en nylig introdusert fragmenteringsteknikk for MS/MS og blir fortsatt undersøkt.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Toward a general mechanism of electron capture dissociation|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2004.11.001|url=http://dx.doi.org/10.1016/j.jasms.2004.11.001|dato=Februar 2005|fornavn=Erik A.|etternavn=Syrstad|etternavn2=Turecček|fornavn2=František|serie=2|bind=16|sider=208–224|issn=1044-0305|besøksdato=2021-04-17}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Complementary Sequence Preferences of Electron-Capture Dissociation and Vibrational Excitation in Fragmentation of Polypeptide Polycations|publikasjon=Angewandte Chemie International Edition|doi=10.1002/anie.200601240|url=http://doi.wiley.com/10.1002/anie.200601240|dato=2006-08-11|fornavn=Mikhail M.|etternavn=Savitski|etternavn2=Kjeldsen|fornavn2=Frank|etternavn3=Nielsen|fornavn3=Michael L.|etternavn4=Zubarev|fornavn4=Roman A.|serie=32|språk=en|bind=45|sider=5301–5303|issn=1433-7851|besøksdato=2021-04-17}}</ref> Mekanismen for ECD er fremdeles under debatt, men ser ut til å ikke nødvendigvis bryte det svakeste båndene, og antas derfor å være en rask prosess der energi ikke er fri til å slappe av intramolekylært. Det er kommet forslag om at radikale reaksjoner initiert av elektronet kan være ansvarlige for virkningen av ECD.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron Capture Dissociation Initiates a Free Radical Reaction Cascade|publikasjon=Journal of the American Chemical Society|doi=10.1021/ja028831n|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ja028831n|dato=Juli 2003|fornavn=Nancy|etternavn=Leymarie|etternavn2=Costello|fornavn2=Catherine E.|etternavn3=O'Connor|fornavn3=Peter B.|serie=29|språk=en|bind=125|sider=8949–8958|issn=0002-7863|besøksdato=2021-04-17}}</ref> I en lignende MS/MS-fragmenteringsteknikk som kalles [[elektronoverføring dissosiasjon]], overføres elektronene ved kollisjon mellom analytkationene og reagensanionene.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron transfer dissociation of peptide anions|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2005.01.015|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b02431|dato=Juni 2005|fornavn=Joshua J.|etternavn=Coon|etternavn2=Shabanowitz|fornavn2=Jeffrey|etternavn3=Hunt|fornavn3=Donald F.|etternavn4=Syka|fornavn4=John E. P.|serie=6|språk=en|bind=16|sider=880–882|issn=1044-0305|besøksdato=2021-04-17}}{{Død lenke|dato=desember 2021 |bot=InternetArchiveBot }}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron Capture/Transfer versus Collisionally Activated/Induced Dissociations: Solo or Duet?|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2008.03.007|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b03191|dato=Juni 2008|fornavn=Roman A.|etternavn=Zubarev|etternavn2=Zubarev|fornavn2=Alexander R.|etternavn3=Savitski|fornavn3=Mikhail M.|serie=6|språk=en|bind=19|sider=753–761|besøksdato=2021-04-17}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron capture and transfer dissociation: Peptide structure analysis at different ion internal energy levels|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2008.11.016|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b03423|dato=April 2009|fornavn=Hisham Ben|etternavn=Hamidane|etternavn2=Chiappe|fornavn2=Diego|etternavn3=Hartmer|fornavn3=Ralf|etternavn4=Vorobyev|fornavn4=Aleksey|etternavn5=Moniatte|fornavn5=Marc|etternavn6=Tsybin|fornavn6=Yury O.|serie=4|språk=en|bind=20|sider=567–575|issn=1044-0305|besøksdato=2021-04-17}}</ref>
Redigeringsforklaring:
Merk at alle bidrag til Wikisida.no anses som frigitt under Creative Commons Navngivelse-DelPåSammeVilkår (se
Wikisida.no:Opphavsrett
for detaljer). Om du ikke vil at ditt materiale skal kunne redigeres og distribueres fritt må du ikke lagre det her.
Du lover oss også at du har skrevet teksten selv, eller kopiert den fra en kilde i offentlig eie eller en annen fri ressurs.
Ikke lagre opphavsrettsbeskyttet materiale uten tillatelse!
Avbryt
Redigeringshjelp
(åpnes i et nytt vindu)
Denne siden er medlem av 1 skjult kategori:
Kategori:CS1-vedlikehold: PMC-format
Navigasjonsmeny
Personlige verktøy
Ikke logget inn
Brukerdiskusjon
Bidrag
Opprett konto
Logg inn
Navnerom
Side
Diskusjon
norsk bokmål
Visninger
Les
Rediger
Rediger kilde
Vis historikk
Mer
Navigasjon
Forside
Siste endringer
Tilfeldig side
Hjelp til MediaWiki
Verktøy
Lenker hit
Relaterte endringer
Spesialsider
Sideinformasjon