Redigerer Holocaust i Litauen (avsnitt)

===Endelig likvidering===
[[Fil:Detail of 'Burning of the Corpses at the Ninth Fort' - 1943 Drawing by Slave Laborer Anatoli Garnik-Gran - Ninth Fort - Kaunas - Lithuania (27306683133) (2).jpg|thumb|Brenning av lik i det niende fort. Tegning av Anatoli Garnik som ble tvunget til å utføre arbeidet som skulle skjule sporene etter forbrytelsen.]]
Våren 1943 ble situasjonen stadig verre for jødiske litauere. Fra april 1943 til 1944 pågikk en gradvis utslettelse av gettoene ved drap eller ved deportering. De små gettoene i Švenčionys og på hviterussisk side ble «likvidert» med til sammen over 6500 beboere – 4000 ble drept i Ponari 5. april (de fikk «spesialbehandling» ifølge politiets rapport) og resten ble flyttet til andre gettoer.<ref name="Arad2005" /> 

Bakgrunnen for beslutningen om likvidering var tiltagende partisanvirksomhet i Hviterussland og tyskerne trodde at jødene ville forsøke å bryte ut og slutte seg til partisanene, noe som til en viss grad skjedde. Himmler ga 21. juni 1943 ordre om å likvidere gettoene i ''Ostland'' og i stedet lage konsentrasjonsleirer for de arbeidsføre direkte underlagt SS. Som følge av denne ordren ble barn og eldre i gettoene straks drept.<ref name="Arad2005" /> 

Bakgrunnen for ordren var blant annet svekket tysk stilling ved [[Beleiringen av Leningrad|Leningrad]] og behov for arbeidskraft til anlegg av festninger i Estland. Gettoen i Vilnius ble «likvidert» (oppløst) og av nær 19&nbsp;000 beboere ble 11&nbsp;000 i september overført til Latvia og Estland, mens 3500 kvinner, barn og eldre ble drept (hvorav noen i [[Sobibór]]). Omkring tusen personer fra Vilnius flyktet til skogs og sluttet seg til partisanene. Gettoene i Kaunas og i Šiauliai ble gjort om til konsentrasjonsleirer.<ref name="Arad2005" /> 

Før tilbaketrekking fra Baltikum i 1944 oppløste tyskerne alle leirer i Litauen. De internerte ble drept eller deportert til [[Stutthof]] og andre leirer, dette gjaldt også jødiske litauere sendt på tvangsarbeid i Latvia og Estland. For eksempel ble 2000 henrettet i Ponary 2.–3. juli 1944 og 1500 jøder i Kaunas ble drept av tyske soldater før tilbaketrekkingen 12.–14. juli. Ved [[Lagedi]] og [[Klooga]] i Estland drepte SS-vaktene 3000 fanger 19. september, bare seks dager før sovjetiske styrker kom frem.<ref name="Arad2005" />

I 1943 gikk det ut ordre om å skjule sporene etter drapene i det niende fort i Kaunas. En kommando på 60 fanger ble satt til å grave opp og brenne likene. Noen fra denne spesialkommandoen lyktes å flykte.<ref name=":5">Ginaite-Rubinson, S. (2011). ''Resistance and Survival: The Jewish Community in Kaunas 1941-1944.'' Mosaic Press.</ref>