Redigerer Samos (avsnitt)

=== Peloponneskrigen ===
I løpet av [[peloponneskrigen]] (431–404 f.Kr.) allierte Samos seg på Athens' side mot [[Sparta]], og ga havn til den athenske flåten. I [[det athenske sjøforbundet]] holdt de en særegen posisjon og forble aktivt lojale til Athen inntil 440 f.Kr. da en strid med Miletos, hvor Athen hadde tatt beslutning imot dem, provoserte dem til løserive seg. Med en flåte på seksti skip holdt de ut mot en større athensk flåte ledet av [[Perikles]] selv, men etter en langvaring beleiring ble de tvunget til å kapitulere. Samos ble straffet, men [[Thukydid]]es forteller at de ikke var så hardt som andre bystater som gjorde opprør mot Athen. De fleste hadde blitt tvunget til å betale tributt, men Samos måtte kun betale de skader som opprøret hadde kostet Athen: 1 300 talenter som ble delt opp i 50 talenter i året.

Mot slutten av peloponneskrigen synes det som om Samons var en av de mest lojale overfor Athen og fungerte fortsatt som base for flåtekrigen mot [[Peloponnes]] og som et midlertidig hjem for det athenske demokrati under [[athenske kuppet i 411 f.Kr.]] I de siste stadier av krigen ble øya belønnet med athensk handelsavtale. Denne vennligsinnede holdningen overfor Athen var et resultat av de politiske omkastningene som endte i etableringen av et demokrati. Etter at Athen ble beseiret, ble Samos beleiret av [[Lysandros]], kommandant av over den [[sparta]]nske flåten som slo [[Athen]] ved [[Slaget ved Aigospotamoi|Aigospotamoi]] i [[405 f.Kr.]]. Samos ble da plassert under et [[oligarki]].

I 394 f.Kr. trakk den spartanske flåten seg tilbake og Samos erklærte sin uavhengighet. Samtidig innførte de demokratiet på nytt, men ved fredsavtalen til [[Antalkidas]] i 387 f.Kr., den såkalte kongefreden, havnet Samos igjen under persisk overherredømme. Den ble frigjort av athenerne i 355 etter en beleiring på 11 måneder, og mottok en større styrke militære som bosatte seg på øya, ''klēroukhia'', som var avgjørende i den sosiale krigen (357-355 f.Kr.). Etter [[den lamiske krig]] (322 f.Kr.), da Athen ble berøvet Samos, kunne øyas omskiftninger ikke lenger bli fulgt.