Redigerer Tandem massespektrometri (avsnitt)

=== Elektronfangst og overføringsmetoder ===
Energien som frigjøres når et elektron overføres til eller fanges opp av et multipladdet ion, kan indusere fragmentering.

==== Elektronfangstdissosiasjon ====
Hvis et [[elektron]] tilsettes et multiladdet positivt ion, frigjøres [[Coulombs lov|Coulomb-energien]]. Å legge til et fritt elektron kalles elektronfangsdissosiasjon (ECD),<ref>{{Kilde artikkel|tittel=The role of electron capture dissociation in biomolecular analysis: ELECTRON CAPTURE DISSOCIATION|publikasjon=Mass Spectrometry Reviews|doi=10.1002/mas.20014|url=http://doi.wiley.com/10.1002/mas.20014|dato=mars 2005|fornavn=Helen J.|etternavn=Cooper|etternavn2=Håkansson|fornavn2=Kristina|etternavn3=Marshall|fornavn3=Alan G.|serie=2|språk=en|bind=24|sider=201–222|besøksdato=2021-02-17}}</ref> og er representert med:

: <math chem="">[\ce M + n\ce H]^{n+} + \ce{e^- ->} \left[ [\ce M + (n-1)\ce H]^{(n-1)+} \right]^* \ce{-> fragmenter}</math>

for et multiplisert protonert molekyl M.

==== Elektronoverføring dissosiasjon ====
Tilsetning av et elektron gjennom en ion-ion-reaksjon kalles elektronoverføring dissosiasjon (ETD).<ref name="pmid15210983">{{cite journal|vauthors=Syka JE, Coon JJ, Schroeder MJ, Shabanowitz J, Hunt DF|title=Peptide and protein sequence analysis by electron transfer dissociation mass spectrometry|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|volume=101|issue=26|pages=9528–33|date=juni 2004|pmid=15210983|pmc=470779|doi=10.1073/pnas.0402700101|bibcode=2004PNAS..101.9528S}}</ref><ref name="pmid17118725">{{cite journal|vauthors=Mikesh LM, Ueberheide B, Chi A, Coon JJ, Syka JE, Shabanowitz J, Hunt DF|title=The utility of ETD mass spectrometry in proteomic analysis|journal=Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics|volume=1764|issue=12|pages=1811–22|date=desember 2006|pmid=17118725|pmc=1853258|doi=10.1016/j.bbapap.2006.10.003}}</ref> I likhet med elektronfangst-dissosiasjon, induserer ETD fragmentering av [[Kation|kationer]] (f.eks. [[Peptid|Peptider]] eller [[Protein|proteiner]]) ved å overføre elektroner til dem. Den ble oppfunnet av Donald F. Hunt, Joshua Coon, John E. P. Syka og Jarrod Marto ved [[University of Virginia]].<ref>{{US patent reference|number=7534622|y=2009|m=05|d=19|inventor=Donald F. Hunt, Joshua J. Coon, John E.P. Syka, Jarrod A. Marto|title=Electron transfer dissociation for biopolymer sequence mass spectrometric analysis}}</ref>

ETD bruker ikke frie elektroner, men benytter radikale anioner (f.eks. [[Antracen]] eller [[azobenzen]]) til dette formålet:

: <math chem="">[\ce M + n\ce H]^{n+} + \ce{A^- ->} \left[ [\ce M + (n-1)\ce H]^{(n-1)+} \right]^* + \ce{A -> fragments}</math>

hvor A er anionet.<ref name="pmid10360331">{{cite journal|vauthors=McLuckey SA, Stephenson JL|title=Ion/ion chemistry of high-mass multiply charged ions|journal=Mass Spectrometry Reviews|volume=17|issue=6|pages=369–407|year=1998|pmid=10360331|doi=10.1002/(SICI)1098-2787(1998)17:6<369::AID-MAS1>3.0.CO;2-J|bibcode=1998MSRv...17..369M|url=https://zenodo.org/record/1235512}}</ref>
 
ETD spaltes tilfeldig langs peptidrygraden (c- og z-ioner) mens sidekjeder og modifikasjoner som fosforylering blir liggende intakte. Teknikken fungerer bare bra for ioner med høyere ladningstilstand (z> 2), men i forhold til kollisjonsindusert dissosiasjon (CID) er ETD fordelaktig for fragmentering av lengre peptider eller til og med hele proteiner. Dette gjør teknikken viktig for ovenfra og ned proteomikk. I likhet med ECD er ETD effektiv for peptider med modifikasjoner som fosforylering.<ref name="pmid17287358">{{cite journal|vauthors=Chi A, Huttenhower C, Geer LY, Coon JJ, Syka JE, Bai DL, Shabanowitz J, Burke DJ, Troyanskaya OG, Hunt DF|title=Analysis of phosphorylation sites on proteins from Saccharomyces cerevisiae by electron transfer dissociation (ETD) mass spectrometry|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|volume=104|issue=7|pages=2193–8|date=februar 2007|pmid=17287358|pmc=1892997|doi=10.1073/pnas.0607084104|bibcode=2007PNAS..104.2193C}}</ref>

Elektronoverføring og høyere energi kollisjon dissosiasjon (EThcD) er en kombinasjon ETD og HCD der peptidforløperen først blir utsatt for en ion/ion-reaksjon med fluorantenanioner i en [[lineær ionefelle]], som genererer c- og z-ioner.<ref name="pmid15210983" /><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Toward Full Peptide Sequence Coverage by Dual Fragmentation Combining Electron-Transfer and Higher-Energy Collision Dissociation Tandem Mass Spectrometry|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac3025366|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac3025366|dato=2012-11-20|fornavn=Christian K.|etternavn=Frese|etternavn2=Altelaar|fornavn2=A. F. Maarten|etternavn3=van den Toorn|fornavn3=Henk|etternavn4=Nolting|fornavn4=Dirk|etternavn5=Griep-Raming|fornavn5=Jens|etternavn6=Heck|fornavn6=Albert J. R.|etternavn7=Mohammed|fornavn7=Shabaz|serie=22|språk=en|bind=84|sider=9668–9673|issn=0003-2700|besøksdato=2021-04-17}}</ref> I det andre trinnet påføres HCD allionfragmentering på alle ETD-avledede ioner for å generere b- og y-ioner før den endelige analysen i [[orbitrap]]-analysatoren.<ref name=":3" /> Denne metoden benytter dobbelt fragmentering for å generere ion- og dermed datarike MS/MS-spektre for peptidsekvensering og PTM-lokalisering.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Unambiguous Phosphosite Localization using Electron-Transfer/Higher-Energy Collision Dissociation (EThcD)|publikasjon=Journal of Proteome Research|doi=10.1021/pr301130k|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/pr301130k|dato=mars 2013|fornavn=Christian K.|etternavn=Frese|etternavn2=Zhou|fornavn2=Houjiang|etternavn3=Taus|fornavn3=Thomas|etternavn4=Altelaar|fornavn4=A. F. Maarten|etternavn5=Mechtler|fornavn5=Karl|etternavn6=Heck|fornavn6=Albert J. R.|etternavn7=Mohammed|fornavn7=Shabaz|serie=3|språk=en|bind=12|sider=1520–1525|issn=1535-3893|pmc=PMC3588588|pmid=23347405|besøksdato=2021-04-17}}</ref>

==== Negativ elektronoverføringsdissosiasjon ====
Fragmentering kan også forekomme med et deprotonert specie, der et elektron overføres fra speciet til et kationisk reagens i en negativ elektronoverføringsdissosiasjon (forkortet til NETD fra engelsk  negative electron transfer dissociation): <ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron transfer dissociation of peptide anions|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/j.jasms.2005.01.015|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b02431|dato=juni 2005|fornavn=Joshua J.|etternavn=Coon|etternavn2=Shabanowitz|fornavn2=Jeffrey|etternavn3=Hunt|fornavn3=Donald F.|etternavn4=Syka|fornavn4=John E. P.|serie=6|språk=en|bind=16|sider=880–882|issn=1044-0305|besøksdato=2021-04-17}}</ref>

<chem>[M-nH]^{n-} {+} A+ -> [[M-nH]^{(n{+}1)-}]^{'} {+}A -> fragmenter</chem>

Etter denne overføringshendelsen gjennomgår det elektronmanglende anionet en intern omorganisering og [[Fragmentering (massespektrometri)|fragmenterer]]. NETD er ion/ion-analog for elektron-løsrivelsesdissosiasjon (EDD). 

NETD er kompatibel med fragmentering av [[Peptid|peptider]] og [[Protein|proteiner]] langs ryggraden ved C<sub>α</sub>-C-bindingen. De resulterende fragmentene er vanligvis en a<sup>•</sup>- og x-type produktioner. 

==== Elektron-løsrivelse dissosiasjon ====
Elektron-løsrivelse dissosiasjon  (forkortet til EDD fra engelsk ''electron-detachment dissociation'') er en metode for fragmentering av anioniske specier i massespektrometri.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Electron detachment dissociation of peptide di-anions: an electron–hole recombination phenomenon|publikasjon=Chemical Physics Letters|doi=10.1016/S0009-2614(01)00501-2|url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0009261401005012|dato=juli 2001|fornavn=Bogdan A.|etternavn=Budnik|etternavn2=Haselmann|fornavn2=Kim F.|etternavn3=Zubarev|fornavn3=Roman A.|serie=3-4|språk=en|bind=342|sider=299–302|besøksdato=2021-04-17}}</ref> Den fungerer som en negativ motmodus for dissosiasjon med elektronfangst. Negativt ladede ioner aktiveres ved bestråling med elektroner med moderat kinetisk energi. Resultatet er utstøting av elektroner fra det ioniske modermolekylet, som forårsaker dissosiasjon via rekombinasjon. 

==== Ladningsoverføringsdissosiasjon ====
Reaksjon mellom positivt ladede peptider og kationiske reagenser,<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Fragmentation of Positively-Charged Biological Ions Activated with a Beam of High-Energy Cations|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac403193k|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac403193k|dato=2014-01-07|fornavn=Konstantin|etternavn=Chingin|etternavn2=Makarov|fornavn2=Alexander|etternavn3=Denisov|fornavn3=Eduard|etternavn4=Rebrov|fornavn4=Oleksii|etternavn5=Zubarev|fornavn5=Roman A.|serie=1|språk=en|bind=86|sider=372–379|issn=0003-2700|besøksdato=2021-04-17}}</ref> også kjent som ladningsoverføringsdissosiasjon (forkortet til CTD fra engelsk ''charge-transfer dissociation''),<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Charge Transfer Dissociation (CTD) Mass Spectrometry of Peptide Cations Using Kiloelectronvolt Helium Cations|publikasjon=Journal of The American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1007/s13361-014-0989-6|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b04667|dato=november 2014|fornavn=William D.|etternavn=Hoffmann|etternavn2=Jackson|fornavn2=Glen P.|serie=11|språk=en|bind=25|sider=1939–1943|issn=1044-0305|besøksdato=2021-04-17}}</ref> har nylig blitt demonstrert som en alternativ høyenergifragmenteringsvei for lavladningstilstand (1+ eller 2+) peptider . Den foreslåtte mekanismen for CTD ved bruk av heliumkationer som reagens er: 

<math>[M {+}H]^{1+} {+} He+ -> [[M{+}H]^{2+}]^' {+} He^0 -> fragmenter</math>

Innledende rapporter er at CTD forårsaker ryggrad C<sub>α</sub>-C  binding spalting av peptider og gir en a<sup>•</sup>- og x-type produktioner.