Redigerer Sima de los Huesos (avsnitt)

====Forholdet til andre menneskearter====
[[Fil:Humans phylogeny from SH DNA.svg|thumb|upright=1.5|alt=Árbol filogenético de los linajes humanos propuesto en 2016 según el ADN de la Sima de los Huesos|Hypotetisk rekonstruksjon av forskjellige menneskelige arter, foreslått i 2016 i henhold til DNA-funnene i Sima de los Huesos.<ref name="Meyer2013"/><ref name="Meyer2016"/>]]
I 2013 utførte man en analyse av [[mitokondrielt DNA]] av et lårbein fra Sima de los Huesos.<ref name="Meyer2013"/> I 2016 ble det mulig å analysere [[nukleært DNA]], noe som på denne tiden var det eldste menneskelige DNA som noen gang er analysert.<ref name="Meyer2016"/>

Studiene konkluderte med at genene tilhører arkaiske neandertalere. Genomet viser et slektskap med klassiske neandertalere, noe som ble påpekt av den morfologiske analysen.<ref name="Arsuaga2014"/> Både i analysene fra 2013 og 2016, var deres DNA beslektet med ''homo denisova''.<ref name="Meyer2013"/><ref name="Arsuaga2014"/><ref name="Meyer2016"/>

En slik flyt av mitokondrielt DNA kan skyldes at neandertalerhanner paret seg med hunner fra en annen populasjon.<ref name="Pääbo2015"/> Dette kan knyttes til ankomsten av [[acheuléen]]kulturen til [[Europa]] fra Afrika for rundt 650 000 år siden, og til utviklingen av [[moustérienkulturen]] for rundt 300 000 år siden.<ref name="Lycett2009"/><ref name="Lahr1998"/> En afrikansk genstrøm kan også forklare fraværet av neandertaler-egenskaper i europeiske fossiler fra mellompleistocen. Både ''[[homo cepranensis]]'', [[underkjeven fra Mala Balanica]] og [[Petralonagrotten|Petralonakraniet]] er morfologiske mellomformer mellom ''homo erectus'' og ''homo heidelbergensis'' som mangler neandertalertrekk.<ref name="Dennell2010"/><ref name="Rink2013"/>

Et studium av genomet antyder at ''homo sapiens sapiens'', ''homo denisova'' og neandertalere skilte lag som tre ulike arter for mellom 550 000 og 760 000 år siden. Verken Tautavelmennesket (300 000 til 400 000 år) eller Petralonamennesket er derfor deres felles stamfar.<ref name="Stringer2012"/><ref name="Meyer2016"/>