Redigerer Tandem massespektrometri (avsnitt)

=== Kildefragmentering ===
Ofte er [[Ionisering|ioniseringsprosessen]] tilstrekkelig voldsom til å etterlate de resulterende ionene med tilstrekkelig indre energi til å fragmenteres i massespektrometeret. Hvis produktionene vedvarer i sin ikke-likevektstilstand i moderat tid før auto-dissosiasjon, kalles denne prosessen metastabil fragmentering.<ref>{{Kilde oppslagsverk|tittel=transient (chemical) species|url=http://goldbook.iupac.org/T06451.html|utgiver=IUPAC|oppslagsverk=IUPAC Compendium of Chemical Terminology|dato=2009-06-12|besøksdato=2021-02-17|isbn=978-0-9678550-9-7|doi=10.1351/goldbook.t06451|språk=en|redaktørfornavn=Miloslav|redaktøretternavn=Nič}}</ref> Fragmentering av dyse-skimmer refererer til målrettet induksjon av kildefragmentering ved å øke dyseskimmer-potensialet på vanligvis elektrospraybaserte instrumenter. Selv om fragmentering i kilden tillater fragmenteringsanalyse, er det ikke teknisk tandem-massespektrometri med mindre metastabile ioner masseanalyseres eller velges før auto-dissosiasjon og et andre analysetrinn utføres på de resulterende fragmentene. Kildefragmentering kan brukes i stedet for tandem massespektrometri gjennom bruk av forbedret kildefragmenteringannotonering (ofte forkortet EISA fra engelsk <span lang="en">Enhanced in-Source Fragmentation Annotation</span>) teknologi som genererer fragmentering som direkte samsvarer med tandem massespektrometri data.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Autonomous METLIN-Guided In-source Fragment Annotation for Untargeted Metabolomics|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/acs.analchem.8b03126|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b03126|dato=2019-03-05|fornavn=Xavier|etternavn=Domingo-Almenara|etternavn2=Montenegro-Burke|fornavn2=J. Rafael|etternavn3=Guijas|fornavn3=Carlos|etternavn4=Majumder|fornavn4=Erica L.-W.|etternavn5=Benton|fornavn5=H. Paul|etternavn6=Siuzdak|fornavn6=Gary|serie=5|språk=en|bind=91|sider=3246–3253|issn=0003-2700|pmc=|pmid=|besøksdato=2021-02-17}}</ref> Fragmenter observert av EISA har høyere signalintensitet enn tradisjonelle fragmenter som lider tap i kollisjonscellene til tandem massespektrometre.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Enhanced in-Source Fragmentation Annotation Enables Novel Data Independent Acquisition and Autonomous METLIN Molecular Identification|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/acs.analchem.0c00409|url=https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.analchem.0c00409|dato=2020-04-21|fornavn=Jingchuan|etternavn=Xue|etternavn2=Domingo-Almenara|fornavn2=Xavier|etternavn3=Guijas|fornavn3=Carlos|etternavn4=Palermo|fornavn4=Amelia|etternavn5=Rinschen|fornavn5=Markus M.|etternavn6=Isbell|fornavn6=John|etternavn7=Benton|fornavn7=H. Paul|etternavn8=Siuzdak|fornavn8=Gary|serie=8|språk=en|bind=92|sider=6051–6059|issn=0003-2700|besøksdato=2021-02-17}}</ref> EISA muliggjør oppsamling av fragmenteringsdata på MS1-masseanalysatorer som flytid og enkelt kvadrupolinstrumenter. Kildefragmentering brukes ofte i tillegg til tandem massespektrometri (med etterkildefragmentering) for å tillate to trinn med fragmentering i en pseudo MS3-type eksperimenter.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Nano electrospray combined with a quadrupole ion trap for the analysis of peptides and protein digests|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/1044-0305(95)00626-5|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b00833|dato=februar 1996|fornavn=Roman|etternavn=Körner|etternavn2=Wilm|fornavn2=Matthias|etternavn3=Morand|fornavn3=Kenneth|etternavn4=Schubert|fornavn4=Michael|etternavn5=Mann|fornavn5=Matthias|serie=2|språk=en|bind=7|sider=150–156|issn=1044-0305|besøksdato=2021-02-17}}</ref>