Redigerer Protozo (avsnitt)

== Systematikk ==
Protozoene ble i tidligere systematikk inndelt i fire grupper (som ofte ble oppfattet som klasser): [[dyreflagellater]] (Zoomastigophora), [[slimdyr]] (Rhizopoda), [[sporedyr]] (Sporozoa) og [[flimmerdyr]] (Ciliophora). Med unntak av flimmerdyrene, som inntar en helhetlig gruppe, er disse gruppene splittet opp og fordelt rundt om i systemet - og mange grupper, særlig de små dyreflagellatene og [[amøbe]]ne, har ennå ikke funnet sin rette plass. Ifølge Mora med flere (2011) fins det cirka 36&nbsp;400 [[art]]er med protozoer.<ref name="Mora">{{Kilde www |url=http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1001127 |tittel=Mora C, Tittensor DP, Adl S, Simpson AGB, Worm B (2011) ''How Many Species Are There on Earth and in the Ocean?'' PLoS Biol 9(8): e1001127. doi:10.1371/journal.pbio.1001127 |besøksdato=2011-11-09 |arkiv-dato=2012-03-06 |arkiv-url=https://web.archive.org/web/20120306121707/http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1001127 |url-status=yes }}</ref>

Dyreflagellatene fordeler seg på rike [[Archezoa]] (tarmflagellatene, f.eks. Giardia), rike [[Euglenozoa]] (kinetoplastidene, f.eks. sovesykeflagellater), rike [[Alveolata]] (dyreliknende fureflagellater, f.eks. morildorganismen nattlys), dyreriket [[Dyr|Animalia]] (krageflagellater), samt en rekke uplasserte former.

Slimdyrene fordeler seg på rike [[Amoebozoa]] (amøber med avrundedte (lobose) pseudopodier, og dessuten [[slimsopp]]ene) og rike [[Cercozoa]] (amøber med [[filamentøse pseudopodier]], [[poredyr]] (Foraminifera), og de noe mer fjerntstående [[radiolarier]]). [[Soldyr]] ble også regnet til slimdyrene, men inntar i dag en isolert stilling og er ennå ikke skikkelig plassert (kanskje nær Cercozoa).

Sporedyrene, som alle er parasitter med sporelignende stadier, er blitt splittet i flere grupper. De to største er de egentlige sporedyrene og [[mikrosporid]]ene. De egentlig sporedyrene (Apicomplexa) (f.eks. malariaparasittene Plasmodium), tilhører rike Alveolata, og må nærmest betraktes som alger siden de inneholder plastider (riktignok uten klorofyll). Mikrosporidene (Microspora) slutter seg til [[soppriket]] (Fungi).

[[Flimmerdyr]]ene, med [[tøffeldyr]], [[trompetdyr]] og [[klokkedyr]], er de mest kompliserte encellete organismene vi kjenner. De tilhører også rike Alveolata, men har ikke plastider.