Redigerer Ligandstyrt ionekanal (avsnitt)

== Cys-loop reseptorer ==
[[Fil:2bg9 opm.gif|right|thumb|270px|Nicotin acetylkolin reseptor i lukket form med forutsette membrangrenser er vist, PDB 2BG9]]

[[Cys-loop reseptorer]] er navngitt etter en karakterisisk loopformet dusulfidbinding mellom to cystein i det N-terminale ekstracellulære domenet. De er underinndelt med hensyn til hva slags ioner de leder (anioniske eller kationiske) og videre delt inn i familier definert av deres endogene ligander. De er vanligvis pentamere hvor hver subenhet innehar 4 transmembrane alpha helixer som utgjør et transmembrane domene og et 'beta sheet sandwich type', extracellulært, N-terminal, ligandbindings domene.<ref name="pmid15023997">{{cite journal | author = Cascio M | title = Structure and function of the glycine receptor and related nicotinicoid receptors | journal = J. Biol. Chem. | volume = 279 | issue = 19 | pages = 19383–6 | year = 2004 | pmid = 15023997 | doi = 10.1074/jbc.R300035200 }}</ref> Noen innehar også et intracellulært domene som vist på bildet.

Den prototypiske ionekanalen er nikotin acetylkolin reseptoren. Den består av en pentamer av protein subenheter (typisk ααβγδ), med to bindingsseter for acetylkolin (en på grensesnittet på hver av alfasubenhetene. Når acetylkolin bindes forandres reseptorens konfigurasjon (vrir T2 helixene som flytter leucinet, som blokker poren, vekk). Dette forårsaker sammentrekningen i poren, som er på ca 3 angstrøm, til å vie seg ut til ca. 8 angstrøm slik at ioner kan passere igjennom. Denne poren lar Na<sup>+</sup> ioner forflytte seg i henhold til den elektrokjemiske gradienten og inn i cellen. Med et tilstrekkelig antall kanaler som åpner seg på en gang vil influxen av positive Na<sup>+</sup> ioner depolarisere den postsynaptiske membranen slik at et aksjonspotensial blir initiert.

Til tross for at encellede organismer, som bakterier, har et lite tilsynelatende behov for transmisjon av aksjonspotensialet har en bakteriell homolog av en ligandstyrt ionekanal blitt identifisert. Hypotesen er at den fungerer som en kjemoreseptor.<ref name="pmid15642096">{{cite journal | author = Tasneem A, Iyer L, Jakobsson E, Aravind L | title = Identification of the prokaryotic ligand-gated ion channels and their implications for the mechanisms and origins of animal Cys-loop ion channels | journal = Genome Biology | volume = 6 | issue = 1 | pages = R4 | year = 2004 | pmid = 15642096 | doi = 10.1186/gb-2004-6-1-r4 | pmc = 549065 }}</ref> Denne prokariotiske nAChR varianten er kjent som GLIC, og fikk navn etter arten den ble identifisert i;  <u>G</u>loeobacter <u>L</u>igand-gated <u>I</u>on <u>C</u>hannel.

'''Anioniske Cys-loop Reseptorer til virveldyr'''
{| class="wikitable"
|-
! Type
! Class
! IUPHAR-anbefalte <br/> proteinnavn<ref name="IUPHAR">{{cite journal | author = Collingridge GL, Olsen RW, Peters J, Spedding M | title = A nomenclature for ligand-gated ion channels | journal = Neuropharmacology | volume = 56 | issue = 1 | pages = 2–5 |date=januar 2009 | pmid = 18655795 | doi = 10.1016/j.neuropharm.2008.06.063 | url = | pmc = 2847504 }}</ref>
! Tidligere navn
|-
| rowspan = "8" align="center" | [[GABAA receptor|GABA]]<sub>A</sub>
| align="center" | alpha
| align="center" | α<sub>1</sub><br />α<sub>2</sub><br />α<sub>3</sub><br />α<sub>4</sub><br />α<sub>5</sub><br />α<sub>6</sub>
| align="center" | EJM, ECA4<br />
|-
| align="center" | beta
| align="center" | β<sub>1</sub><br />β<sub>2</sub><br />β<sub>3</sub>
| align="center" |  <br />  <br /> ECA5
|-
| align="center" | gamma
| align="center" | γ<sub>1</sub><br />γ<sub>2</sub><br />γ<sub>3</sub><br />
| align="center" | CAE2, ECA2, GEFSP3
|-
| align="center" | delta
| align="center" | δ
| align="center" |
|-
| align="center" | epsilon
| align="center" | ε
| align="center" |
|-
| align="center" | pi
| align="center" | π
| align="center" |
|-
| align="center" | theta
| align="center" | θ
| align="center" |
|-
| align="center" | rho
| align="center" | ρ<sub>1</sub><br />ρ<sub>2</sub><br />ρ<sub>3</sub>
| align="center" |GABA<sub>C</sub><ref name="pmid18790874">{{cite journal | author = Olsen RW, Sieghart W | title = International Union of Pharmacology. LXX. Subtypes of γ-Aminobutyric AcidA Receptors: Classification on the Basis of Subunit Composition, Pharmacology, and Function. Update | journal = Pharmacol. Rev. | volume = 60 | issue = 3 | pages = 243–60 |date=september 2008 | pmid = 18790874 | doi = 10.1124/pr.108.00505 | url = | pmc = 2847512 }}</ref>
|-
| rowspan = "2" align="center" | [[Glysin reseptor|Glysin]]<br />(GlyR)
| align="center" | alpha
| align="center" | α<sub>1</sub><br />α<sub>2</sub><br />α<sub>3</sub><br />α<sub>4</sub>
| align="center" |STHE <br /> <br />
|-
| align="center" | beta
| align="center" | β
| align="center" |
|}

'''Kationiske Cys-loop Reseptorer til virveldyr'''
{| class="wikitable"
|-
|-
! Type
! Class
! IUPHAR-anbefalte <br/> proteinnavn <ref name="IUPHAR"/>
! Tidligere navn
|-
| align="center" | [[Serotonin receptor|Serotonin]]<br />(5-HT)
| align="center" | [[5-HT3 receptor|5-HT<sub>3</sub>]]
| align="center" | |5-HT3A<br />5-HT3B<br />5-HT3C<br />5-HT3D<br />5-HT3E
| align="center" | 5-HT<sub>3A</sub><br />5-HT<sub>3B</sub><br />5-HT<sub>3C</sub><br />5-HT<sub>3D</sub><br />5-HT<sub>3E</sub>
|-
| rowspan = "5" align="center" | [[Nicotin acetylkolin reseptor|Nicotin acetylkolin]]<br />(nAChR)
| align="center" | alpha
| align="center" | α<sub>1</sub><br />α<sub>2</sub><br />α<sub>3</sub><br />α<sub>4</sub><br />α<sub>5</sub><br />α<sub>6</sub><br />α<sub>7</sub><br />α<sub>9</sub><br />α<sub>10</sub>
| align="center" |ACHRA, ACHRD, CHRNA, CMS2A, FCCMS, SCCMS<br /> <br/> <br/> <br/> <br/> <br/> <br/> <br/>
|-
| align="center" | beta
| align="center" | β<sub>1</sub><br />β<sub>2</sub><br />β<sub>3</sub><br />β<sub>4</sub>
| align="center" |CMS2A, SCCMS, ACHRB, CHRNB, CMS1D<br />EFNL3, nAChRB2<br /> <br/>
|-
| align="center" | gamma
| align="center" | γ
| align="center" |ACHRG
|-
| align="center" | delta
| align="center" | δ
| align="center" |ACHRD, CMS2A, FCCMS, SCCMS
|-
| align="center" | epsilon
| align="center" | ε
| align="center" |ACHRE, CMS1D, CMS1E, CMS2A, FCCMS, SCCMS
|-
| align="center" | Zinc-aktivert ionekanal <br />(ZAC)
| align="center" |
| align="center" | ZAC
| align="center" | ZAC1, L2m LGICZ, LGICZ1
|}